Międzynarodowy Instytut Mechanizmów i Maszyn Molekularnych PAN uzyskał dotację z Unii Europejskiej na projekt FENG.02.02-IP.05-0074/24 “Regulacja ekspresji białek spliceosomu jako innowacyjny cel terapeutyczny w procesach chorobowych krwi związanych z zapaleniem”.

Projekt zakłada opracowanie nowatorskiego podejścia terapeutycznego ukierunkowanego na regulację odpowiedzi zapalnej w chorobach przednowotworowych krwi. Koncentrujemy się na roli SF3B1 jako kluczowego regulatora splicingu i jego wpływie na zapalenie. Wykorzystując analizy transkryptomiczne, translatomiczne i proteomiczne, wskażemy nowe cele terapeutyczne i potwierdzimy ich znaczenie w modelach komórkowych i zwierzęcych.
Celem praktycznym jest stworzenie strategii leczniczych opartych na modulacji SF3B1, w tym terapii skojarzonej z inhibitorami CDK8/19, lekami immunomodulującymi oraz modulatorami splicingu w modelu klonalnej hematopoezy.
Projekt łączy odkrycia podstawowe z rozwojem preklinicznych interwencji, otwierając drogę do nowych metod leczenia stanów zapalnych i chorób hematologicznych wynikających z zaburzonej regulacji splicingu.

W ramach tego projektu ocenimy, czy modulacja spliceosomu, szczególnie białka SF3B1, pozwala kontrolować odpowiedź zapalną poprzez interferonowe szlaki regulacyjne, translacyjne sterowanie składnikami spliceosomu i wpływ na immunogenność komórek krwi. Celem jest określenie, czy ukierunkowany splicing może stać się nową, szeroko stosowalną strategią terapeutyczną w chorobach zależnych od zaburzonego zapalenia.

Projekt skierowany jest do środowisk naukowych, klinicznych i przemysłowych zajmujących się terapiami chorób zapalnych, hematologicznych i nowotworowych. Wyniki badań dostarczą nowych celów molekularnych dla rozwoju leków modulujących splicing oraz strategii terapii skojarzonej w chorobach przewlekłych i zakażeniach wirusowych. Bezpośrednymi beneficjentami będą firmy biotechnologiczne i farmaceutyczne, a także lekarze i pacjenci cierpiący na choroby związane z zaburzoną odpowiedzią zapalną.
Współpraca z prof. René Bernardsem (NKI, Amsterdam) oraz firmą Ryvu Therapeutics zwiększa potencjał translacyjny projektu i umożliwia szybkie przełożenie wyników badań na etapy przedkliniczne i kliniczne, tworząc realne podstawy dla wdrożenia nowych terapii.

Projekt oferuje nowe spojrzenie na kontrolę odpowiedzi zapalnej w chorobach krwi, stawiając SF3B1 w centrum regulacji splicingu jako potencjalny punkt uchwytu terapeutycznego. W pierwszym etapie, modulując SF3B1, zbadamy, jak zmiany jego aktywności wpływają na komórki stymulowane interferonem. Zintegrowane analizy transkryptomiczne, proteomiczne i fenotypowe pozwolą wyłonić kluczowe szlaki sygnałowe, nowe neoantygeny i dodatkowe cele terapeutyczne.
Drugi etap skupi się na ocenie terapii skojarzonej. Połączenie modulatorów SF3B1 z RVU120 i inhibitorami punktów kontrolnych ma umożliwić wzmocnienie odpowiedzi immunologicznej i zwiększenie podatności patologicznych komórek na leczenie. Ocena w modelach klonalnej hematopoezy pozwoli określić skuteczność, bezpieczeństwo i optymalne kombinacje terapeutyczne.
W szerszej perspektywie projekt ma wytyczyć nowy kierunek terapeutyczny: precyzyjne sterowanie splicingiem w zapaleniu i zwiększenie immunogenności komórek chorobowych. Jeśli strategia okaże się skuteczna i skalowalna, zaoferuje klinicznie realną, szeroko stosowalną metodę leczenia chorób zależnych od dysfunkcyjnej odpowiedzi zapalnej z wyraźnym wpływem społecznym i translacyjnym.

Wartość projektu: 4.000.000 zł

Wysokość wkładu z Funduszy Europejskich: 4.000.000 zł

—

The International Institute of Molecular Mechanisms and Machines of the Polish Academy of Sciences has received European Union funding for the project FENG.02.02-IP.05-0074/24 “Regulation of spliceosome protein expression as an innovative therapeutic target in inflammation-related blood diseases”.

The project aims to develop an innovative therapeutic approach targeting inflammatory responses in pre-malignant blood disorders. We focus on the role of SF3B1 as a key splicing regulator and its impact on inflammation. Using transcriptomic, translatomic, and proteomic analyses, we will identify new therapeutic targets and validate their relevance in cell-based and animal models.
The practical objective is to establish treatment strategies centered on SF3B1 modulation, including combination therapies with CDK8/19 inhibitors, immunomodulatory drugs, and splicing modulators in a model of clonal hematopoiesis.
The project integrates fundamental discoveries with the development of preclinical interventions, paving the way for new therapeutic options for inflammatory and hematologic diseases driven by dysregulated splicing.

In this project, we will assess whether modulation of the spliceosome, particularly the SF3B1 protein, can be used to control inflammatory responses through interferon-regulated pathways. It will also examine how translational regulation of spliceosomal components influences the immunogenicity of blood cells. The goal is to determine whether targeted splicing can become a new, broadly applicable therapeutic strategy for diseases driven by dysregulated inflammation.

The project is aimed at scientific, clinical, and industrial communities working on therapies for inflammatory, hematologic, and cancer-related diseases. The results will provide new molecular targets for developing splicing-modulating drugs and combination-therapy strategies for chronic diseases and viral infections. Direct beneficiaries will include biotechnology and pharmaceutical companies, as well as physicians and patients affected by disorders linked to dysregulated inflammatory responses.
Collaboration with Prof. René Bernards (NKI, Amsterdam) and Ryvu Therapeutics enhances the project’s translational potential and enables rapid transfer of findings into preclinical and clinical development, creating a realistic pathway toward implementing new therapies.

The project offers a new perspective on regulating inflammatory responses in blood disorders, positioning SF3B1 as a central splicing regulator and a potential therapeutic leverage point. In the first phase, we will modulate SF3B1 to examine how changes in its activity affect interferon-stimulated cells. Integrated transcriptomic, proteomic, and phenotypic analyses will uncover key signaling pathways, novel neoantigens, and additional therapeutic targets.
The second phase will focus on evaluating combination therapies. Pairing SF3B1 modulators with RVU120 and immune checkpoint inhibitors is expected to enhance immune responses and increase the vulnerability of pathological cells to treatment. Testing in models of clonal hematopoiesis will determine efficacy, safety, and optimal therapeutic combinations.
More broadly, the project aims to establish a new therapeutic direction: precise control of splicing in inflammation and enhanced immunogenicity of diseased cells. If successful and scalable, this strategy could provide a clinically viable, widely applicable approach for treating disorders driven by dysfunctional inflammatory responses, with substantial translational and societal impact.

Total project value: 4.000.000 zł

Amount of the contribution from European Funds: 4.000.000 zł